Con 85 voti su 88, Biagio Malorgio entra a far parte della Segreteria della CGIL Puglia. Malorgio sposato con 2 figli inizia l'attività sindacale, dopo la laurea in pedagogia, presso lo SPI del Comprensorio di Casarano.

Dal 1984 al 1992 dirige la Federbraccianti, in seguito divenuta FLAI, dello stesso Comprensorio. Nel 1992 entra nella segreteria provinciale della CGIL di Lecce, della quale diviene il Segretario Generale nel 2000. Carica che ha ricoperto fino ad oggi, quando è stato chiamato a far parte della segreteria della CGIL Puglia.

Malorgio integra la segreteria rimasta sguarnita dopo l'elezione di Mimmo Pantaleo alla guida della FLC nazionale.